MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008340	GTG	2	6	220101	220106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319351
5002	NC_008340	GCC	2	6	220114	220119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319351
5003	NC_008340	CTG	2	6	220140	220145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319351
5004	NC_008340	GCC	2	6	220197	220202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319351
5005	NC_008340	TGC	3	9	220288	220296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319351
5006	NC_008340	GGC	2	6	220298	220303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319351
5007	NC_008340	CAT	2	6	220316	220321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319351
5008	NC_008340	TCA	2	6	220339	220344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319351
5009	NC_008340	GCT	2	6	220361	220366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319351
5010	NC_008340	GAT	2	6	220367	220372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319351
5011	NC_008340	TCG	2	6	220408	220413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319351
5012	NC_008340	TGG	2	6	220444	220449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319351
5013	NC_008340	CGG	2	6	220450	220455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319351
5014	NC_008340	TGG	2	6	220483	220488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319351
5015	NC_008340	CTG	2	6	220545	220550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319351
5016	NC_008340	CCA	2	6	220678	220683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319351
5017	NC_008340	GTG	2	6	220716	220721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319351
5018	NC_008340	CTGGT	2	10	220725	220734	0 %	40 %	40 %	20 %	114319351
5019	NC_008340	GCC	3	9	220797	220805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319351
5020	NC_008340	CGC	2	6	220844	220849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319351
5021	NC_008340	GGCC	2	8	220862	220869	0 %	0 %	50 %	50 %	114319351
5022	NC_008340	G	6	6	220871	220876	0 %	0 %	100 %	0 %	114319351
5023	NC_008340	TGG	3	9	220945	220953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319351
5024	NC_008340	G	6	6	220958	220963	0 %	0 %	100 %	0 %	114319351
5025	NC_008340	GGT	2	6	220985	220990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319351
5026	NC_008340	TCT	2	6	221011	221016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319351
5027	NC_008340	CTG	2	6	221061	221066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319351
5028	NC_008340	ATC	2	6	221076	221081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319351
5029	NC_008340	TTCA	2	8	221085	221092	25 %	50 %	0 %	25 %	114319351
5030	NC_008340	CCG	2	6	221131	221136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319351
5031	NC_008340	GCT	2	6	221208	221213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319352
5032	NC_008340	TCC	2	6	221216	221221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319352
5033	NC_008340	GCC	2	6	221230	221235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319352
5034	NC_008340	CTG	3	9	221239	221247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319352
5035	NC_008340	GTG	2	6	221266	221271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319352
5036	NC_008340	CCG	2	6	221272	221277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319352
5037	NC_008340	TTC	2	6	221284	221289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319352
5038	NC_008340	CTG	2	6	221314	221319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319352
5039	NC_008340	TGG	2	6	221342	221347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319352
5040	NC_008340	CCCTGG	2	12	221348	221359	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319352
5041	NC_008340	GGC	2	6	221419	221424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319352
5042	NC_008340	GAG	2	6	221461	221466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319352
5043	NC_008340	CTG	2	6	221554	221559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319352
5044	NC_008340	GTG	2	6	221560	221565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319352
5045	NC_008340	GCT	2	6	221577	221582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319352
5046	NC_008340	G	6	6	221624	221629	0 %	0 %	100 %	0 %	114319352
5047	NC_008340	CAT	2	6	221640	221645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319352
5048	NC_008340	TGC	2	6	221672	221677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319352
5049	NC_008340	TCT	2	6	221678	221683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319352
5050	NC_008340	G	6	6	221703	221708	0 %	0 %	100 %	0 %	114319352
5051	NC_008340	AGG	2	6	221732	221737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319352
5052	NC_008340	GCG	2	6	221792	221797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319352
5053	NC_008340	GGCG	2	8	221964	221971	0 %	0 %	75 %	25 %	114319352
5054	NC_008340	CGG	2	6	222020	222025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319352
5055	NC_008340	GGGC	2	8	222057	222064	0 %	0 %	75 %	25 %	114319352
5056	NC_008340	TGG	2	6	222074	222079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319352
5057	NC_008340	GGGC	2	8	222092	222099	0 %	0 %	75 %	25 %	114319352
5058	NC_008340	CCG	2	6	222128	222133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319352
5059	NC_008340	TTC	2	6	222154	222159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319352
5060	NC_008340	G	6	6	222200	222205	0 %	0 %	100 %	0 %	114319352
5061	NC_008340	TGG	2	6	222206	222211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319352
5062	NC_008340	CGA	2	6	222305	222310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319353
5063	NC_008340	GCC	3	9	222314	222322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319353
5064	NC_008340	CGA	2	6	222404	222409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319353
5065	NC_008340	CTG	2	6	222549	222554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319353
5066	NC_008340	TGA	2	6	222676	222681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319353
5067	NC_008340	GGC	2	6	222694	222699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319353
5068	NC_008340	AGC	2	6	222709	222714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319353
5069	NC_008340	AGG	3	9	222754	222762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319353
5070	NC_008340	GCC	2	6	222771	222776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319353
5071	NC_008340	GGTCG	2	10	222812	222821	0 %	20 %	60 %	20 %	114319353
5072	NC_008340	CTG	2	6	222822	222827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319353
5073	NC_008340	GCT	3	9	222842	222850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319353
5074	NC_008340	CGG	2	6	222880	222885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319353
5075	NC_008340	CTG	2	6	222906	222911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319353
5076	NC_008340	GGT	4	12	222935	222946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319353
5077	NC_008340	CACCGT	2	12	222983	222994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114319353
5078	NC_008340	GAG	2	6	223077	223082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319353
5079	NC_008340	CGG	2	6	223122	223127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319354
5080	NC_008340	ACC	2	6	223210	223215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319354
5081	NC_008340	GCA	2	6	223256	223261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319354
5082	NC_008340	CAG	2	6	223300	223305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319354
5083	NC_008340	GC	3	6	223309	223314	0 %	0 %	50 %	50 %	114319354
5084	NC_008340	GGA	2	6	223368	223373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319354
5085	NC_008340	CGG	2	6	223465	223470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319354
5086	NC_008340	G	7	7	223469	223475	0 %	0 %	100 %	0 %	114319354
5087	NC_008340	GCA	4	12	223491	223502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319354
5088	NC_008340	TGC	2	6	223526	223531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319354
5089	NC_008340	CTG	3	9	223543	223551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319354
5090	NC_008340	GAG	2	6	223624	223629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319354
5091	NC_008340	CTG	2	6	223642	223647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319354
5092	NC_008340	CAA	2	6	223701	223706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319354
5093	NC_008340	AGCG	2	8	223950	223957	25 %	0 %	50 %	25 %	114319355
5094	NC_008340	AGG	2	6	224053	224058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319355
5095	NC_008340	CTG	2	6	224088	224093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319355
5096	NC_008340	GGAC	2	8	224146	224153	25 %	0 %	50 %	25 %	114319355
5097	NC_008340	CGG	2	6	224159	224164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319355
5098	NC_008340	TGC	2	6	224197	224202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319355
5099	NC_008340	CTGG	2	8	224210	224217	0 %	25 %	50 %	25 %	114319355
5100	NC_008340	GCT	2	6	224243	224248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319355
5101	NC_008340	TGG	2	6	224263	224268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319355
5102	NC_008340	GGCG	2	8	224273	224280	0 %	0 %	75 %	25 %	114319355
5103	NC_008340	TCGG	2	8	224289	224296	0 %	25 %	50 %	25 %	114319355
5104	NC_008340	CGGCG	2	10	224372	224381	0 %	0 %	60 %	40 %	114319355
5105	NC_008340	CAT	2	6	224405	224410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319355
5106	NC_008340	GTG	2	6	224412	224417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319355
5107	NC_008340	GCC	2	6	224448	224453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319355
5108	NC_008340	TTC	2	6	224484	224489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319355
5109	NC_008340	TAC	2	6	224586	224591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319355
5110	NC_008340	GGT	2	6	224594	224599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319355
5111	NC_008340	CGC	2	6	224675	224680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319355
5112	NC_008340	CCA	2	6	224689	224694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319355
5113	NC_008340	TGC	2	6	224701	224706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319355
5114	NC_008340	CGG	2	6	224729	224734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319355
5115	NC_008340	TGG	2	6	224772	224777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319355
5116	NC_008340	CTT	3	9	224801	224809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319355
5117	NC_008340	ACC	3	9	224859	224867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319355
5118	NC_008340	GCT	2	6	224903	224908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319355
5119	NC_008340	TCG	2	6	224914	224919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319355
5120	NC_008340	CGG	2	6	225017	225022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319355
5121	NC_008340	TCC	2	6	225034	225039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319355
5122	NC_008340	GCC	2	6	225041	225046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319355
5123	NC_008340	CAC	2	6	225083	225088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319355
5124	NC_008340	GGT	2	6	225125	225130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319355
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5128	NC_008340	TAG	2	6	225325	225330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319356
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5130	NC_008340	CTGCCG	2	12	225392	225403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319356
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5151	NC_008340	GCC	2	6	226134	226139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319356
5152	NC_008340	GCC	2	6	226237	226242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319356
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5227	NC_008340	CCT	2	6	229121	229126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319358
5228	NC_008340	TCC	2	6	229153	229158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319358
5229	NC_008340	GGC	2	6	229163	229168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319358
5230	NC_008340	TCG	2	6	229207	229212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319358
5231	NC_008340	TGCT	2	8	229226	229233	0 %	50 %	25 %	25 %	114319358
5232	NC_008340	TGACC	2	10	229355	229364	20 %	20 %	20 %	40 %	114319359
5233	NC_008340	GGC	2	6	229365	229370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319359
5234	NC_008340	GCA	2	6	229382	229387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319359
5235	NC_008340	G	6	6	229388	229393	0 %	0 %	100 %	0 %	114319359
5236	NC_008340	CCA	2	6	229544	229549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319359
5237	NC_008340	GCA	2	6	229580	229585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319359
5238	NC_008340	CAG	2	6	229647	229652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319359
5239	NC_008340	CCG	2	6	229675	229680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319359
5240	NC_008340	TGC	2	6	229750	229755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319359
5241	NC_008340	CCAG	2	8	229769	229776	25 %	0 %	25 %	50 %	114319359
5242	NC_008340	CAC	2	6	229788	229793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319359
5243	NC_008340	CCCGG	2	10	229803	229812	0 %	0 %	40 %	60 %	114319359
5244	NC_008340	CGGC	3	12	229842	229853	0 %	0 %	50 %	50 %	114319359
5245	NC_008340	GCA	2	6	229859	229864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319359
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5247	NC_008340	CGG	2	6	229913	229918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319359
5248	NC_008340	ATC	2	6	229924	229929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319359
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5253	NC_008340	GGCG	2	8	230086	230093	0 %	0 %	75 %	25 %	114319360
5254	NC_008340	GTCCAC	2	12	230135	230146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114319360
5255	NC_008340	AGT	2	6	230203	230208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319360
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5260	NC_008340	CTGG	2	8	230387	230394	0 %	25 %	50 %	25 %	114319360
5261	NC_008340	GGC	2	6	230470	230475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319360
5262	NC_008340	GCC	2	6	230517	230522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319360
5263	NC_008340	CGT	2	6	230524	230529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319360
5264	NC_008340	AAC	2	6	230595	230600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319360
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5270	NC_008340	TGGACG	2	12	230733	230744	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319360
5271	NC_008340	GCTG	2	8	230749	230756	0 %	25 %	50 %	25 %	114319360
5272	NC_008340	G	6	6	230768	230773	0 %	0 %	100 %	0 %	114319360
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5282	NC_008340	TAC	2	6	231305	231310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319361
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5290	NC_008340	TGG	2	6	231641	231646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319361
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5357	NC_008340	GCCG	2	8	234719	234726	0 %	0 %	50 %	50 %	114319363
5358	NC_008340	CGC	2	6	234755	234760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319363
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5361	NC_008340	TGC	2	6	234805	234810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
5362	NC_008340	TGC	2	6	234818	234823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
5363	NC_008340	CTG	2	6	234825	234830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
5364	NC_008340	GC	3	6	234862	234867	0 %	0 %	50 %	50 %	114319363
5365	NC_008340	CCGG	2	8	234881	234888	0 %	0 %	50 %	50 %	114319363
5366	NC_008340	TGC	2	6	234892	234897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
5367	NC_008340	CGGC	2	8	234935	234942	0 %	0 %	50 %	50 %	114319363
5368	NC_008340	GC	3	6	234983	234988	0 %	0 %	50 %	50 %	114319363
5369	NC_008340	GGCC	2	8	235061	235068	0 %	0 %	50 %	50 %	114319363
5370	NC_008340	TTC	2	6	235092	235097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319363
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5375	NC_008340	GAG	2	6	235338	235343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319363
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5380	NC_008340	GCG	2	6	235640	235645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319363
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5382	NC_008340	GTC	2	6	235671	235676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
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5385	NC_008340	GTC	2	6	235726	235731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319364
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5389	NC_008340	AGC	2	6	235989	235994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319365
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5393	NC_008340	CGG	2	6	236080	236085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319365
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5398	NC_008340	ACC	2	6	236328	236333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319365
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5400	NC_008340	CCGG	2	8	236350	236357	0 %	0 %	50 %	50 %	114319365
5401	NC_008340	CCA	2	6	236389	236394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319365
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5432	NC_008340	GCG	2	6	237933	237938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319366
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5440	NC_008340	CAG	2	6	238214	238219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319366
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5444	NC_008340	GC	3	6	238361	238366	0 %	0 %	50 %	50 %	114319366
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5473	NC_008340	CCCGG	2	10	239531	239540	0 %	0 %	40 %	60 %	114319368
5474	NC_008340	GGTC	2	8	239666	239673	0 %	25 %	50 %	25 %	114319368
5475	NC_008340	G	6	6	239718	239723	0 %	0 %	100 %	0 %	114319368
5476	NC_008340	GC	3	6	239745	239750	0 %	0 %	50 %	50 %	114319368
5477	NC_008340	GCA	2	6	239753	239758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319368
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5479	NC_008340	CACG	2	8	239793	239800	25 %	0 %	25 %	50 %	114319368
5480	NC_008340	GCT	2	6	239985	239990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319369
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5482	NC_008340	GAT	2	6	240040	240045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319369
5483	NC_008340	AGA	2	6	240090	240095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319369
5484	NC_008340	CGG	2	6	240102	240107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319369
5485	NC_008340	G	6	6	240174	240179	0 %	0 %	100 %	0 %	114319369
5486	NC_008340	GGCG	2	8	240300	240307	0 %	0 %	75 %	25 %	114319369
5487	NC_008340	TGG	2	6	240360	240365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319369
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5490	NC_008340	GCC	2	6	240598	240603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319370
5491	NC_008340	CAG	2	6	240610	240615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319370
5492	NC_008340	CAG	3	9	240618	240626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319370
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5499	NC_008340	CG	3	6	240864	240869	0 %	0 %	50 %	50 %	114319370
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